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Cloning and Sequencing Analysis of tuf Gene of the P hytoplasma Associated with Jujube Witches Broom in Xinjiang

HAN Jian;XU Jin-hong;WANG Tong-ren;ZHANG Xiang-lin;LUO Ming   

  • Received:2013-03-25 Revised:2013-03-25 Online:2013-03-25 Published:2013-03-25

新疆枣疯病植原体tuf基因的克隆与序列分析

韩剑;徐金虹;王同仁;张祥林;罗明   

  1. 新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052;阿瓦提县农技推广中心,新疆阿瓦提,843200;新疆出入境检验检疫局,乌鲁木齐,830063

摘要: [目的]枣疯病是一种重要的植原体病害,了解新疆枣疯病植原体的系统发育关系及遗传分化,获取其分子特征信息.[方法]利用植原体tuf基因通用引物fTufu/rTufu对新疆枣疯病病株总DNA进行PCR扩增,对部分扩增片段克隆、测序及相似性分析.[结果]获得新疆枣疯病阿克苏株系(JWB-ASZ)和喀什株系(JWB-KHZ)的tuf基因片段分别为841和814 bp.经同源性比较分析,新疆枣疯病阿克苏株系(JWB-ASZ)与喀什株系(JWB-KHZ)均隶属于16S rV-B亚组枣疯病植原体.其中JWB-KHZ株系与枣疯病植原体河北株系的tuf基因核苷酸及氨基酸同源性最高,分别达到90.2;和81.5;;JWB-ASZ与枣疯病植原体陕西株系的tuf基因核苷酸及氨基酸同源性最高,分别达到94.2;和94.6;,而与16S rV其它亚组的核苷酸及氨基酸同源性均低于70;.枣疯病阿克苏株系与喀什株系的tuf基因核苷酸及氨基酸序列之间存在明显差异,同源性仅为为73.5;和63.5;.[结论]研究报道了新疆枣疯病植原体tuf基因序列,为揭示新疆枣疯病植原体不同株系的分子特征、分子变异和遗传多样性提供了基础.