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Xinjiang Agricultural Sciences

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Cloning of BVDV Structural Protein Gene and Predictions of B Lymphocyte Epitopes of Structural Protein

HE Yan-hua;HUANG Xin;BO Xin-wen;ZHONG Fang-gang;HAN Meng-li;CHEN Nan-ying;WANG Xin-hua   

  • Received:2012-02-25 Revised:2012-02-25 Online:2012-02-25 Published:2012-02-25

牛病毒性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测

何延华;黄新;薄新文;钟发刚;韩猛立;陈南颖;王新华   

  1. 新疆农垦科学院/新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室,新疆石河子,832000





摘要： [目的]以免疫信息学和反向疫苗学为理论根据,应用生物信息学相关软件和方法,对BVDV结构蛋白( Structural Protein,SP)的二级结构的不同方面及其B细胞表位进行了预测,综合评价了BVDV结构蛋白的抗原特异性细胞表位,并计算出一些潜在的抗原位点.[方法]利用RT- PCR扩增法获得牛病毒性腹泻病毒结构蛋白序列,通过克隆、测序分析结构蛋白基因的基因组序列和蛋白序列,采用DNAStar Protean软件对结构蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行综合分析,并预测其B细胞的抗原表位分布.[结果]P14、gp48和gp53蛋白含有的细胞优势抗原表位较多,有的甚至有可能成为优势抗原表位或对优势抗原表位有协同作用.[结论]与已鉴定的B细胞抗原表位相比,试验所用方法预测的结果有较高的准确度,是一种较为先进的表位研究方法.