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Xinjiang Agricultural Sciences

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Analysis of Microbial Diversity in Rectum of Health Calves

XU Qiang;MA Xun;KANG Li-chao;BO Xin-wen;WANG Xin-hua   

  • Received:2012-01-25 Revised:2012-01-25 Online:2012-01-25 Published:2012-01-25

健康犊牛直肠细菌的多样性

许强;马勋;康立超;薄新文;王新华   

  1. 石河子大学动物科技学院,新疆石河子832003;新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室,新疆石河子832000;石河子大学动物科技学院,新疆石河子,832003;新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室,新疆石河子,832000





摘要： [目的]研究分析健康犊牛直肠细菌的多样性.[方法]通过建立直肠菌群16S rRNA基因克隆文库,分别用限制性内切酶MspⅠ和HhaⅠ对阳性克隆的PCR产物进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,通过测定16S rRNA基因序列,绘制进化树,确定健康犊牛直肠菌群的组成.[结果]克隆阳性率达96.45;(488/506),Msp Ⅰ得到64种分类操作单元(OTU,Operational Taxonomic Unit),HhaⅠ得到45种OTU,综合获得143种OTU.测序比对表明健康犊牛直肠优势菌群分属梭菌属(13;)、双歧杆菌属(8;)、拟杆菌属(3;)、真杆菌属(3;)、乳杆菌属(2;)、普氏菌属(2;)、埃希菌属(4;)、巨型球菌属(5;)和不可培养菌(8;).[结论]健康犊牛直肠菌群复杂多样,且多为专性厌氧菌,以梭菌属、双歧杆菌属和巨型球菌属为主要类群.此外,巨型球菌属在1～2周龄犊牛直肠中具有独特性.