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Cloning of Cyclophilin(GhCyp2) in Gossypium hirsutum and Its Quantitative Analysis by Real- Time RT- PCR

WU Li;WANG Ya-qin;ZHANG Xin-yu;SUN Jie;LI Yan-jun   

  • Received:2011-09-25 Revised:2011-09-25 Online:2011-09-25 Published:2011-09-25

棉花亲环素基因GhCYP2的克隆及实时定量表达分析

吴莉;王雅琴;张新宇;孙杰;李艳军   

  1. 石河子大学生命科学学院,新疆石河子,832003;石河子大学农学院,新疆石河子,832003

摘要: [目的]分离棉花中的亲环素基因.亲环素基因是一类多基因蛋白质家族,广泛存在于高等植物各个组织和器官中,参与多种重要的生理生化过程.[方法]以小麦亲环素wCyP3基因蛋白序列(AF262984)为探针序列,在GenBank中与棉花EST序列进行tBLASTn比对,将同源性高的EST序列拼接后获得一条长912 bp的cDNA序列.[结果]序列分析表明,该cDNA含有一个编码174个氨基酸的开放阅读框,基因的编码产物为亲环素蛋白,将该基因命名为GhCYP2(GenBank登录号:JN032296).采用Clustal X将ChCYP2的氨基酸序列与其他生物亲环素氨基酸序列进行相似性比对,发现与水稻、拟南芥等生物的相似性较高,达到80;以上.利用实时荧光定量PCR技术分析了GhCYP2在棉花各个组织器官中的表达模式,检测结果显示:GhCYP2在棉花叶及18DPA棉纤维中的表达量最高,在根、茎、花、3~15DPA、21~30DPA棉纤维中均有适量表达.[结论]推测GhCYP2可能在棉花纤维伸长至次生壁合成的重叠期发挥着信号传导作用.