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Study on the Molecular Characteristics of Partial Sequence from Different Sources Isolates of Apple stem Grooving Virus

HUANG Yan-yan;WANG Guo-Ping;HONG Ni   

  • Received:2011-02-25 Revised:2011-02-25 Online:2011-02-25 Published:2011-02-25

不同来源苹果茎沟病毒分离物部分序列分子特性研究

黄妍妍;王国平;洪霓   

  1. 塔里木大学植物科学学院,新疆阿拉尔,843300;湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室,武汉,430070;湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室,武汉,430070

摘要: [目的]明确为害新疆不同品种梨的苹果茎沟病毒(Apple Stem Grooving Virus,ASGV)侵染状况,并对获得的病毒基因序列进行分子鉴定.[方法]采用生物学和分子生物学方法对来源于新疆梨、砂梨及红梨上的ASGV进行检测,将获得基因序列进行比对分析.[结果]从10份新疆梨、2份砂梨及3份云南红梨样品上扩增到预期大小为500 by的ASGV扩增产物.对扩增产物进行克隆和测序,序列分析的结果显示,15个ASGV分离物的CP基因核昔酸及其编码的氨基酸序列相似性分别为88.2;-100;和95.6;-100;,CP基因核苷酸序列构建系统发育树显示,来源于库尔勒香梨分离物KII-3、KII-5、KII-7和新梨7号的分离物XII-5、XII -6,与早期已报道的库尔勒香梨分离物KRL-1及砂梨分离物P-6-1-17亲缘关系较近,聚集成簇.此外,库尔勒香梨的分离物KII-10、KII-14及新粱7号的分离物XII-10与云南红梨上2个分离物YN-2和YN-4聚集成簇,遗传距离较近.[结论]CP基因核昔酸序列系统发育树显示,来源于新获不同品种梨的8个ASGV 分离物及红梨上3个ASGV分离物位于两个不同的组群,存在复杂遗传变异现象.