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In Silico Cloning of Triptychon in Cotton

ZHENG Peng;CHEN Quan-jia;GAO Wen-wei;ZHANG Yan-ni;Qu Yan-ying   

  • Received:2010-09-25 Revised:2010-09-25 Online:2010-09-25 Published:2010-09-25

棉花TRY基因的电子克隆

郑鹏;陈全家;高文伟;张艳妮;曲延英   

  1. 新疆农业大学农业生物技术重点实验室,乌鲁木齐,830052

摘要: [目的]克隆棉花TRIPTYCHON(TRY)基因.[方法]利用电子克隆和RT-PCR相结合的方法,克隆棉花TRY基因,并利用生物信息学分析软件,分析棉花TRY蛋白的生物信息.[结果]从徐州142无绒无絮突变体中,克隆到棉花TRY基因,其ORF(Open reading frame )全长270 bp,编码89个氨基酸.棉花TRY蛋白属于不稳定、疏水性蛋白,不存在信号肽及糖基化位点,没有跨膜结构,定位于细胞核,三级结构不存在卷曲螺旋结构.[结论]在棉花中利用电子克隆技术克隆TRY基因是可行的,同时研究结果为进一步研究棉花TRY基因的功能和棉纤维发育调控机制提供理论依据.