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Optimization of cDNA-AFLP Amplification Reaction System in Wheat Leaves

LI Jian-feng;ZHANG Yue-qiang;FAN Zhe-ru;WANG Yan-jun;WANG Hao;QU Yan-ying;FAN Ling   

  • Received:2010-03-25 Revised:2010-03-25 Online:2010-03-25 Published:2010-03-25

小麦叶片cDNA-AFLP扩增反应体系的优化

李剑峰;张跃强;樊哲儒;王岩军;王浩;曲延英;范玲   

  1. 新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐,830091;新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052

摘要: [目的]建立并优化小麦叶片cDNA-AFLP扩增反应体系,进行cDNA-AFLP分析,挖掘新春6号相关抗旱基因.[方法]在盆栽小麦苗期水分胁迫下叶片cDNA-AFLP的试验中,分别对20 μL预扩增和选择性扩增反应体系中的4种反应条件影响因子进行不同梯度优化的研究,包括引物、dNTP、Mg2+及TaqDNA聚合酶的用量.[结果]PCR预扩增20 μL反应体系中,引物(40 mM)1.0 μL、dNTP(2.5 mM)1.8 μL、Mg2+(25 mM)2.2 μL、TaqDNA聚合酶(5U)0.5 μL时预扩增效果较好;PCR选择性扩增20 μL反应体系中,引物(40 mM)0.6 μL、dNTP(2.5 mM)2.0 μL、Mg2+(25 mM)1.6 μL、TaqDNA聚合酶(5U)0.4 μL时,可得到更多清晰可辨的TDFs(transcript derived fragments).[结论]试验通过对引物、dNTP、Mg2+ 、TapDNA聚合酶用量等因子进行筛选,获得较为理想的预扩增和选择性扩增体系,得到了更多有效的条带,为利用cDNA-AFLP研究小麦抗旱相关基因的分离及其克隆奠定了良好的基础.