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Sequence Analysis of NA Gene of H3N8 EIV of Donkey in Southern Xinjiang

LIU Yong-hong;ZHANG Lu-yao;LI Fei;ZHAO Li   

  • Received:2016-08-25 Revised:2016-08-25 Online:2016-08-25 Published:2016-08-25

新疆南疆驴源H3N8亚型EIV NA基因序列分析

刘永宏;张路瑶;李飞;赵丽   

  1. 塔里木大学动物科学学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室,新疆阿拉尔,843300

摘要: [目的]明确新疆南疆驴是否感染EIV,及EIV NA基因特征.[方法]根据GenBank登录的EIV基因序列,设计合成1对引物,针对新疆南疆地区2个驴屠宰点33份驴肺进行EIV NA基因RT-PCR扩增、电泳分析、胶回收、测序及序列分析.[结果]中国新疆南疆驴源EIV A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)株NA基因长1 413 bp,编码470个氨基酸.与国内外H3N8亚型EIV参考毒株核苷酸同源性为75.2; ~ 99.6;,与国内外参考毒株氨基酸同源性为80;~100;,与国内毒株、哈萨克斯坦毒株和印度毒株在一个进化分支内.与GenBank数据库中唯一一个驴源毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)糖基化位点个数和分布位置完全一致.[结论]新疆南疆存在驴感染EIV,可能为国内疫情的延续或周边国家传入.