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Xinjiang Agricultural Sciences

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Studies on Polymorphism and Bioinformatics of 8 Xinjiang Almonds Self-incompatibility Gene (S-gene)

GUO Chun-miao;YANG Bo;Tudi Maimaiti;LI Ning;TANG Ya-ping;GONG Peng;WANG Ji-xun   

  • Received:2016-06-25 Revised:2016-06-25 Online:2016-06-25 Published:2016-06-25

8个新疆扁桃S-基因多态性与生物信息学研究

郭春苗;杨波;吐迪·麦麦提;李宁;唐亚萍;龚鹏;王继勋   

  1. 新疆农业科学院园艺作物研究所/农业部新疆地区果树科学观测试验站,乌鲁木齐,830091;新疆莎车县林业局,新疆莎车,844700

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摘要： [目的]自交不亲和基因(S-基因)在果树及授粉树选配和自交亲和性品种选育等方面具有重要意义,是影响扁桃繁殖性状的重要候选基因,对8个新疆扁桃S-基因序列、基因结构、基因多态性进行研究.[方法]采用Blast、ProtParam和SignalP等生物信息学软件,对8个新疆扁桃S-基因的理化性质、多态性、系统发生树和蛋白结构等进行分析.[结果]新疆扁桃S氨基酸存在信号肽,不是分泌性蛋白,具有跨膜结构,推测S氨基酸可能定位于细胞膜中发挥功能;通过进化树分析,分为两大类群;二级结构由无规则卷曲、α螺旋和延伸链等结构元件组成.[结论]8个新疆扁桃S-基因的理化性质、多态性、系统发生树和蛋白结构等生物信息学分析结果将为S-基因的酶学特性及自交不亲和基因分子机理研究提供理论参考.