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C4H1 Gene Cloning and Expression Analysis between Sea-Island Cotton (Gossypium Barbadense L.) Fiber and Upland Cotton (Gossypium Hirsutum L.) Fiber

  • Received:2015-06-25 Revised:2015-06-25 Online:2015-06-25 Published:2015-06-25

海岛棉与陆地棉纤维C4H1基因克隆及表达分析

曹佳强;吕淑萍;李波;杨洋;张经博;谢丽霞;胡文冉;范玲   

  1. 新疆农业大学农学院,乌鲁木齐830052;新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐830091;新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐,830091

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摘要： [目的]研究海岛棉与陆地棉纤维不同发育时期C4H1基因的表达和结构差异.[方法]分别从海岛棉和陆地棉纤维中克隆C4H1基因的cDNA全长,并利用DNAMAN、MEGA3.1等软件进行C4H1基因的生物信息学分析;采用半定量和实时荧光定量PCR方法,比较海岛棉和陆地棉不同发育时期的棉纤维中C4H1基因的表达水平.[结果]C4H1基因在海岛棉与陆地棉纤维发育不同时期表达具有差异,海岛棉中该基因的表达高峰期在20 DPA,而陆地棉中该基因的表达高峰期在15 DPA.该基因的核酸序列在两种棉花中存在差异,并导致其编码蛋白的氨基酸序列也存在差异,且海岛棉C4H1蛋白中Thr(苏氨酸)含量高于陆地棉,蛋白等电点也耍高于陆地棉.[结论]海岛棉中C4H1基因的表达高峰期晚于陆地棉,两个棉种C4H1蛋白氨基酸序列的差异可能导致其理化性质及生物学功能的改变,为发掘海岛棉纤维品质优异基因奠定了基础.