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Xinjiang Agricultural Sciences

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The Preliminary Establishment of for Detecting the Community Bacterial Density from No.10 Spring in Urumqi by the Real-Time PCR System

TANG Feng;SHI Ying-wu;LI Ping;LUO Jiao;CHA0 Qun-fang   

  • Received:2015-06-25 Revised:2015-06-25 Online:2015-06-25 Published:2015-06-25

乌鲁木齐10号冷泉细菌群落密度实时荧光定量PCR检测体系的建立

唐凤;史应武;李萍;罗娇;晁群芳   

  1. 新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐830046;新疆农业科学院微生物应用研究所,乌鲁木齐830091;新疆农业科学院微生物应用研究所,乌鲁木齐,830091;新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐,830046;石河子大学生命科学学院,新疆石河子,832003

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摘要： [目的]初步建立乌鲁木齐10号冷泉泉水细菌群落的定量分析体系.[方法]选用地震前与地震后的乌鲁木齐10号冷泉水样,以及无震时期的水样做为三种处理方式,利用构建克隆子的方法制作标准样品,并对实时荧光定量PCR标准曲线的线性(R2)、斜率(S)、扩增效率(E)等相关参数进行优化.[结果]标准曲线的线性R2=0.993、以及斜率S=-3.415,E=1.963均基本符合参数要求.震前冷泉水体细菌16 S rDNA片段拷贝数达到1.893×105 cop/mL,震后冷泉水体细菌16 S rDNA片段拷贝数达到1.43×106 cop/mL无震时期水体细菌16 S rDNA片段拷贝数达到9.931×106 cop/mL.[结论]建立的实时荧光定量PCR检测体系符合参数要求,并且可以灵敏地、快速地定量未知模板的乌鲁木齐10号泉细菌数.