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Xinjiang Agricultural Sciences

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Identification and sequence analysis of the Apple scar skin viroid isolated from apple trees in Xinjiang Province

SUN Xiao-xia;WANG Yu-ting;NIU Jian-xin   

  • Received:2015-04-25 Revised:2015-04-25 Online:2015-04-25 Published:2015-04-25

新疆苹果树上苹果锈果类病毒(ASSVd)的检测与全序列分析

孙晓霞;王钰婷;牛建新   

  1. 石河子大学农学院园艺系/特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子,832003

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摘要： [目的]检测并分析新疆223团场多年生苹果树上的苹果锈果类病毒.[方法]对采自新疆库尔勒223团的多年生苹果树的枝条、叶片、果实((果皮、种子))样品进行RNA提取,利用RT-PCR技术检测鉴定.[结果](1)多年生的‘金冠’苹果树上检测到苹果锈果类病毒,得到4条克隆序列(ASSVd Y1:KC110858;ASSVd Y6:KC110859;ASSVd Y8:KC110860;ASSVd Y10:KC110861),所得序列与GenBank中已报道的国内外ASSVd序列同源性达85;以上.(2)序列比对可知,4条‘金冠’分离物序列之间只有3个碱基变异,与首次登录生物X17696有26个碱基变异,其中有4个碱基缺失和5个碱基插入,且变异多集中在类病毒序列的TL与TR区.[结论]通过序列分析比对,各寄主上的ASSVd分离物核酸序列变异较小,建立了优化的RT-PCR检测方法,为苹果树ASSVd的快速检测奠定了良好的基础.